Onmyouji cuenta la historia del renombrado onmyouji Abe no Seimei, quien conoce y se hace amigo del torpe noble de la corte Minamoto no Hiromasa. Juntos, defienden los kyou de la capital Heian de un onmyouji opuesto, Douman, que está planeando en secreto la desaparición del emperador.