En su primer año de universidad, Iori Kitahara se muda al pueblo costero de Izu y se instala encima de Grand Blue, la tienda de buceo de su tío. Iori tiene grandes sueños de vivir la experiencia universitaria ideal, pero al entrar en la tienda, se ve arrastrado hacia las juergas alcohólicas de los relajados miembros del Club de Buceo que frecuentan el lugar. Persuadido por los estudiantes mayores Shinji Tokita y Ryuujirou Kotobuki, Iori acepta a regañadientes unirse a sus fiestas extravagantes. Más tarde, su prima Chisa Kotegawa lo descubre en plena acción, lo que le vale el completo desprecio de ella.

Basada en el popular manga cómico de Kenji Inoue y Kimitake Yoshioka, Grand Blue sigue las desventuras de Iori con sus nuevos amigos excéntricos mientras intenta alcanzar su sueño universitario ideal... y, de paso, aprender a bucear.